中国海洋大学有着重视科学研究的优良传统，坚持科技以人为本，坚持基础研究与应用研究并重，提高学术水平与服务地方经济并重，坚定不移地走特色之路，通过国家重大科技计划项目承担、科研基地建设、创新人才培养与引进、创新成果培育及科技管理机制创新，实现了科技事业的快速发展，科技创新能力和综合实力明显增强。

强化科技创新基地建设，构筑高水平科学研究平台，是汇聚人才、形成团队、提高科技竞争力的关键途径。经过多年的发展，学校科研创新基地建设取得重大进展，实验技术条件得到显著改善。目前，由国家海洋局和教育部共建的中国海洋发展研究中心落户中国海洋大学，以中国海洋大学为依托单位的青岛海洋科学与技术国家实验室正在论证建设中，学校拥有国家海洋药物工程技术研究中心，联合国教科文组织中国海洋生物工程中心，物理海洋、海洋药物、海水养殖、海洋遥感、海底科学与探测技术、海洋环境与生态、海洋化学理论与工程技术等7个教育部重点实验室，海水养殖、海洋材料与防护技术、海洋油气开发与安全保障等3个教育部工程技术研究中心，海岸与近海工程等9个山东省高校重点实验室，海洋精细化工等3个青岛市重点实验室。还有全国高校唯一的海上流动实验室—3500吨级“东方红2号”海洋实习综合调查船。

以科研基地为依托，紧紧围绕国际科技前沿和重大科学问题，以国家创新体系建设与国家中长期科技发展规划及“十一五”科技计划实施为契机，主动适应创新型国家建设和经济社会发展需要，充分发挥海洋、水产等学科的科技优势和多学科交叉的综合优势，大力推进自主创新能力建设，源头创新能力明显增强。“十五”以来，科技突显其强劲的发展势头，科技经费大幅提高，为优秀人才的培养和创新成果的产生奠定了坚实的基础。承担国家973计划、863计划、国家自然科学基金等的项目数居国内涉海单位之首；主持国家“973计划在研项目4项，占该计划涉海项目总数的1/3，列全国第十位；主持国家“863计划”课题129项，总经费2亿元，其中2006年主持国家“863计划”专题课题32项，位列全国第十；主持国家自然科学基金项目年均经费2000多万元（2004-2007年）, 其中，2007年有3人获国家杰出青年科学基金资助，位列全国11位；主持重点基金项目4项，其它基金项目近70项，经费约3000万元。这些项目的实施，不仅标志着我校承担国家重大基础性研究计划的“国家队”地位和原始创新能力的提升，而且在高技术创新、技术集成创新和服务社会经济发展方面又上了一个新台阶，学校核心竞争力和整体科研水平全面提高。

人才是科技创新的主体。学校现有1200余名教学科研人员，其中，有中国科学院和中国工程院院士7人（含双聘院士2人），教育部“长江学者奖励计划”特聘教授和讲座教授11人，国家杰出青年基金项目获得者12人，国家有突出贡献的中青年专家9人，国家“973”计划项目首席科学家4人，首届国家教学名师奖获得者1人，全国模范教师2人，全国优秀教师6人，山东省教学名师奖获得者7人，国家“百千万人才工程”入选者8人，教育部新（跨）世纪优秀人才支持计划入选者44人，教育部“优秀青年教师奖”获得者3人，山东省“泰山学者”特聘教授4人，学校“筑峰/绿卡”人才工程岗位教授13人，享受国务院政府特殊津贴者101人，博士生导师252人。这些优秀人才对于促进学校科技发展和创新人才培养发挥着极其重要的作用。

学校在原始创新和技术创新能力不断增强的同时，具有显示度的科技成果不断产出。“十五”以来，申请发明专利592项，其中获授权发明专利229项；被SCI、EI、ISTP等收录论文2800余篇，2005年被SCI收录数位列高校35位。在海洋、水产、生物、环境、海洋药物等领域，取得了纤毛虫原生动物的分类学、发生与系统学以及生态学研究，海洋平台浪致过度振动控制技术及其工程应用，海水养殖动物的营养学研究及饲料开发与应用，大洋环流能量平衡与海-气相互作用，新型海洋防污涂料关键技术研究及其应用，海洋糖化学研究及糖工程药物的开发，海水养殖生物新品种培育，深海电视抓斗等大批标志性成果，先后获国家自然科学二等奖1项，国家科技进步二等奖3项，山东省科学技术最高奖1项，省部级一等奖22项、二等奖34项。所取得的一系列成果不仅取得了巨大的经济效益，也产生了重大的社会效益。